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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
268485-268594
(-)
TPP
266510-268406 (-)
A3UG_01280
A3UG_01280
Operon
DOOR ID:
1297453
A3UG_01280,
A3UG_01275,
A3UG_01270,
A3UG_01265,
A3UG_01260
(thiG)
,
A3UG_01255
(thiH)
View Structure
2
425144-425188
(+)
mini-ykkC
425216-425534 (+)
A3UG_01995
A3UG_01995
Single gene
DOOR ID:
3860091
A3UG_01995
View Structure
3
553202-553316
(+)
Mg sensor
553414-556123 (+)
A3UG_02575
A3UG_02575
Single gene
DOOR ID:
3860139
A3UG_02575
View Structure
4
776214-776314
(-)
TPP
775198-776182 (-)
tbpA
A3UG_03560
Operon
DOOR ID:
1297541
A3UG_03560
(tbpA)
,
A3UG_03555
(thiP)
,
A3UG_03550
(thiQ)
View Structure
5
1478496-1478630
(+)
MOCO
1479631-1480144 (+)
A3UG_06760
A3UG_06760
Operon
DOOR ID:
1297671
A3UG_06780,
A3UG_06775
(moaE)
,
A3UG_06770
(moaD)
,
A3UG_06765,
A3UG_06760,
A3UG_06755
(moaA)
View Structure
6
1777338-1777507
(-)
ykoK
1776276-1777278 (-)
A3UG_08085
A3UG_08085
Single gene
DOOR ID:
3860542
A3UG_08085
View Structure
7
2193408-2193506
(+)
ykkC-yxkD
2193564-2194623 (+)
A3UG_10125
A3UG_10125
Operon
DOOR ID:
1297791
A3UG_10145,
A3UG_10140,
A3UG_10135,
A3UG_10130,
A3UG_10125
View Structure
8
2197678-2197724
(+)
mini-ykkC
2197742-2201345 (+)
A3UG_10150
A3UG_10150
Operon
DOOR ID:
1297792
A3UG_10155,
A3UG_10150
View Structure
9
2955372-2955561
(+)
yybP-ykoY
2955571-2956138 (+)
A3UG_13735
A3UG_13735
Single gene
DOOR ID:
3861044
A3UG_13735
View Structure
10
3295785-3295881
(-)
TPP
3294977-3295748 (-)
A3UG_15360
A3UG_15360
Operon
DOOR ID:
1297980
A3UG_15360,
A3UG_15355,
A3UG_15350
View Structure
11
4184242-4184392
(-)
FMN
4183481-4184135 (-)
ribB
A3UG_19395
Single gene
DOOR ID:
3861438
A3UG_19395
(ribB)
View Structure
12
4820624-4820800
(-)
cobalamin
4818720-4820481 (-)
btuB
A3UG_22315
Operon
DOOR ID:
1298265
A3UG_22315
(btuB)
,
A3UG_22310
View Structure
Genome:
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens SDM
(
NC_018079.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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