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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
1300138-1300375
(-)
cobalamin
1299898-1300087 (-)
cbtB
BPI_I1362
Operon
DOOR ID:
906974
BPI_I1356,
BPI_I1357,
BPI_I1358,
BPI_I1359,
BPI_I1360,
BPI_I1361,
BPI_I1362
View Structure
2
1339169-1339397
(-)
cobalamin
1337149-1339012 (-)
BPI_I1398
BPI_I1398
Operon
DOOR ID:
906981
BPI_I1395,
BPI_I1396,
BPI_I1397,
BPI_I1398
View Structure
3
299797-300010
(+)
cobalamin
300361-300583 (+)
nrdH
BPI_II311
Operon
DOOR ID:
1317613
BPI_II311,
BPI_II312,
BPI_II313,
BPI_II314
View Structure
4
794143-794375
(-)
cobalamin
792908-793943 (-)
BPI_II809
BPI_II809
Operon
DOOR ID:
1317706
BPI_II807,
BPI_II808,
BPI_II809,
BPI_II810
View Structure
5
729798-729961
(+)
FMN
730037-730514 (+)
ribH-2
BPI_II749
Single gene
DOOR ID:
3241517
BPI_II749
View Structure
6
769040-769124
(-)
glycine
767788-768892 (-)
gcvT
BPI_II780
Operon
DOOR ID:
1317701
BPI_II778,
BPI_II779,
BPI_II780
View Structure
7
339842-339921
(-)
sam-alpha
338554-339751 (-)
metZ
BPI_I340
Single gene
DOOR ID:
3240431
BPI_I340
View Structure
8
1719734-1719904
(+)
TPP
1719942-1720950 (+)
thiB
BPI_I1817
Operon
DOOR ID:
907060
BPI_I1817,
BPI_I1818
View Structure
9
228204-228310
(-)
TPP
227241-228117 (-)
thiD
BPI_I219
Operon
DOOR ID:
906755
BPI_I212,
BPI_I213,
BPI_I214,
BPI_I215,
BPI_I216,
BPI_I217,
BPI_I218,
BPI_I219
View Structure
Genome:
Brucella pinnipedialis B2/94
(
NC_015857.1
);
Taxonomy:
Alphaproteobacteria
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