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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
136716-136818
(+)
SAM
136904-138479 (+)
LMOSLCC7179_0133
LMOSLCC7179_0133
Single gene
DOOR ID:
3913044
LMOSLCC7179_0133
View Structure
2
305178-305297
(-)
SAM
304246-305068 (-)
LMOSLCC7179_0278
LMOSLCC7179_0278
Operon
DOOR ID:
1151946
LMOSLCC7179_0274,
LMOSLCC7179_0275,
LMOSLCC7179_0276,
LMOSLCC7179_0277,
LMOSLCC7179_0278
View Structure
3
332504-332609
(+)
TPP
332695-333370 (+)
LMOSLCC7179_0302
LMOSLCC7179_0302
Operon
DOOR ID:
1151950
LMOSLCC7179_0302,
LMOSLCC7179_0303
(thiM)
,
LMOSLCC7179_0304
(thiD-1)
,
LMOSLCC7179_0305
(thiE)
View Structure
4
574153-574254
(-)
purine
572763-574059 (-)
LMOSLCC7179_0549
LMOSLCC7179_0549
Single gene
DOOR ID:
3913230
LMOSLCC7179_0549
View Structure
5
600962-601062
(-)
SAM
599575-600853 (-)
cysD
LMOSLCC7179_0571
Operon
DOOR ID:
1151998
LMOSLCC7179_0570
(metX)
,
LMOSLCC7179_0571
(cysD)
View Structure
6
719596-719790
(+)
glmS
719875-721681 (+)
glmS
LMOSLCC7179_0706
Single gene
DOOR ID:
3913287
LMOSLCC7179_0706
(glmS)
View Structure
7
789603-789800
(-)
lysine
788052-789513 (-)
lysP
LMOSLCC7179_0775
Single gene
DOOR ID:
3913317
LMOSLCC7179_0775
(lysP)
View Structure
8
844655-844752
(+)
SAM
844846-845950 (+)
LMOSLCC7179_0821
LMOSLCC7179_0821
Single gene
DOOR ID:
3913346
LMOSLCC7179_0821
View Structure
9
869813-869860
(+)
PreQ1
869865-870354 (+)
LMOSLCC7179_0845
LMOSLCC7179_0845
Single gene
DOOR ID:
3913354
LMOSLCC7179_0845
View Structure
10
984119-984222
(+)
yybP-ykoY
984320-985088 (+)
LMOSLCC7179_0972
LMOSLCC7179_0972
Single gene
DOOR ID:
3913389
LMOSLCC7179_0972
View Structure
11
1126464-1126654
(+)
cobalamin
1126806-1127691 (-)
pocR
LMOSLCC7179_1117
Single gene
DOOR ID:
3913437
LMOSLCC7179_1117
(pocR)
View Structure
12
1144731-1144874
(+)
cobalamin
1145291-1146431 (+)
LMOSLCC7179_1139
LMOSLCC7179_1139
Single gene
DOOR ID:
3913439
LMOSLCC7179_1139
View Structure
13
1163136-1163313
(+)
cobalamin
1163474-1164833 (+)
cobB
LMOSLCC7179_1159
Operon
DOOR ID:
1152115
LMOSLCC7179_1159
(cobB)
,
LMOSLCC7179_1160
(cobD)
,
LMOSLCC7179_1161
(cobH)
,
LMOSLCC7179_1162
(cbiD)
,
LMOSLCC7179_1163
(cbiE)
,
LMOSLCC7179_1164
(cbiT)
,
LMOSLCC7179_1165
(cbiF)
View Structure
14
1319484-1319575
(+)
glycine
1319658-1320747 (+)
gcvT
LMOSLCC7179_1318
Operon
DOOR ID:
1152149
LMOSLCC7179_1318
(gcvT)
,
LMOSLCC7179_1319
(gcvP1)
,
LMOSLCC7179_1320
(gcvP2)
View Structure
15
1407807-1407917
(-)
TPP
1407177-1407738 (-)
LMOSLCC7179_1401
LMOSLCC7179_1401
Single gene
DOOR ID:
3913518
LMOSLCC7179_1401
View Structure
16
1661752-1661860
(-)
SAM
1660444-1661644 (-)
metK
LMOSLCC7179_1637
Single gene
DOOR ID:
3913587
LMOSLCC7179_1637
(metK)
View Structure
17
1684700-1684806
(-)
SAM
1682295-1684593 (-)
metE
LMOSLCC7179_1654
Operon
DOOR ID:
1152229
LMOSLCC7179_1651,
LMOSLCC7179_1652
(metC-1)
,
LMOSLCC7179_1653
(metC-2)
,
LMOSLCC7179_1654
(metE)
View Structure
18
1902031-1902131
(-)
purine
1901369-1901948 (-)
xpt
LMOSLCC7179_1857
Operon
DOOR ID:
1152272
LMOSLCC7179_1856
(pbuX)
,
LMOSLCC7179_1857
(xpt)
View Structure
19
1963697-1963819
(-)
FMN
1962895-1963507 (-)
LMOSLCC7179_1917
LMOSLCC7179_1917
Single gene
DOOR ID:
3913662
LMOSLCC7179_1917
View Structure
20
2390114-2390232
(-)
SAM
2389001-2390024 (-)
metN
LMOSLCC7179_2330
Operon
DOOR ID:
1152376
LMOSLCC7179_2328,
LMOSLCC7179_2329
(metI)
,
LMOSLCC7179_2330
(metN)
View Structure
21
2705788-2705954
(-)
ykoK
2702932-2705503 (-)
mgtA
LMOSLCC7179_2659
Operon
DOOR ID:
1152450
LMOSLCC7179_2657,
LMOSLCC7179_2658
(ftsW)
,
LMOSLCC7179_2659
(mgtA)
View Structure
Genome:
Listeria monocytogenes SLCC7179
(
NC_018593.1
);
Phylum:
Firmicutes
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