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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
287194-287375
(-)
ykoK
286122-287136 (-)
A79E_0259
A79E_0259
Single gene
DOOR ID:
3895659
A79E_0259
View Structure
2
687899-688050
(+)
FMN
688155-688809 (+)
A79E_0668
A79E_0668
Single gene
DOOR ID:
3895806
A79E_0668
View Structure
3
931014-931192
(+)
cobalamin
931284-932661 (+)
A79E_0910
A79E_0910
Operon
DOOR ID:
1143419
A79E_0910,
A79E_0911,
A79E_0912,
A79E_0913,
A79E_0914,
A79E_0915,
A79E_0916,
A79E_0917,
A79E_0918,
A79E_0919,
A79E_0920,
A79E_0921,
A79E_0922,
A79E_0923,
A79E_0924,
A79E_0925,
A79E_0926,
A79E_0927,
A79E_0928
View Structure
4
1619029-1619126
(+)
TPP
1619160-1619934 (+)
A79E_1556
A79E_1556
Operon
DOOR ID:
1143550
A79E_1556,
A79E_1557
View Structure
5
2047829-2047931
(-)
yybP-ykoY
2047144-2047711 (-)
A79E_1897
A79E_1897
Single gene
DOOR ID:
3896307
A79E_1897
View Structure
6
2596354-2596455
(-)
TPP
2595589-2596285 (-)
A79E_2438
A79E_2438
Operon
DOOR ID:
1143703
A79E_2435,
A79E_2436,
A79E_2437,
A79E_2438
View Structure
7
3647463-3647601
(-)
MOCO
3645949-3646462 (-)
A79E_3431
A79E_3431
Operon
DOOR ID:
1143880
A79E_3427,
A79E_3428,
A79E_3429,
A79E_3430,
A79E_3431,
A79E_3432
View Structure
8
4488973-4489102
(+)
TPP
4489135-4490119 (+)
A79E_4233
A79E_4233
Operon
DOOR ID:
1144054
A79E_4233,
A79E_4234,
A79E_4235
View Structure
9
4827660-4827776
(-)
Mg sensor
4824852-4827561 (-)
A79E_4543
A79E_4543
Single gene
DOOR ID:
3897274
A79E_4543
View Structure
10
4929149-4929193
(-)
mini-ykkC
4928817-4929135 (-)
A79E_4644
A79E_4644
Operon
DOOR ID:
1144135
A79E_4644,
A79E_4645,
A79E_4646,
A79E_4647
View Structure
11
5071260-5071495
(+)
lysine
5071674-5073024 (+)
A79E_4780
A79E_4780
Single gene
DOOR ID:
3897346
A79E_4780
View Structure
12
5106751-5106875
(+)
TPP
5106960-5108856 (+)
A79E_4811
A79E_4811
Operon
DOOR ID:
1144170
A79E_4811,
A79E_4812,
A79E_4813,
A79E_4814,
A79E_4815,
A79E_4816,
A79E_4817
View Structure
13
5234689-5234876
(-)
cobalamin
5231989-5232841 (-)
A79E_4933
A79E_4933
Single gene
DOOR ID:
3897382
A79E_4933
View Structure
Genome:
Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 1084
(
NC_018522.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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