RiboswitchDB

Genome: Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 (NC_017866.1); Phylum: Actinobacteria

S.No.

Riboswitch Location and Strand

Riboswitch class

Downstream gene location and Strand

Downstream gene name/gene product description

Locus_tag of downstream gene

Single gene/within operon (According to DOOR database)

Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)

Predicted Structure

1

807572-807671 (+)

TPP

808524-808830 (-)

W7Y_0690

Single gene

DOOR ID: 3794766

W7Y_0690

2

813192-813335 (-)

FMN

812591-813188 (-)

W7Y_0693

Operon

DOOR ID: 1094689

W7Y_0692,
W7Y_0693

3

826805-826912 (-)

TPP

826170-826779 (-)

ykoE

Single gene

DOOR ID: 3794773

W7Y_0701 (ykoE)

4

838744-838853 (+)

TPP

838890-839511 (+)

ykoE

Operon

DOOR ID: 1094692

W7Y_0713 (ykoE),
W7Y_0714 (ykoD)

5

1163067-1163204 (+)

TPP

1164192-1165158 (+)

W7Y_1020

Single gene

DOOR ID: 3794911

W7Y_1020

6

1427799-1427899 (+)

TPP

1428851-1430402 (+)

W7Y_1241

Operon

DOOR ID: 1094798

W7Y_1240,
W7Y_1241

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