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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
170720-170916
(+)
yybP-ykoY
170931-171507 (+)
ABTJ_00156
ABTJ_00156
Single gene
DOOR ID:
3790211
ABTJ_00156
View Structure
2
590811-591018
(-)
cobalamin
588903-590775 (-)
ABTJ_00580
ABTJ_00580
Single gene
DOOR ID:
3790396
ABTJ_00580
View Structure
3
1236413-1236516
(-)
SAH
1234994-1236377 (-)
ABTJ_01181
ABTJ_01181
Operon
DOOR ID:
1092371
ABTJ_01179,
ABTJ_01180,
ABTJ_01181
View Structure
4
1649196-1649283
(+)
glycine
1649460-1650705 (+)
ABTJ_01603
ABTJ_01603
Single gene
DOOR ID:
3790838
ABTJ_01603
View Structure
5
2514092-2514187
(-)
ykkC-yxkD
2513322-2514063 (-)
ABTJ_02428
ABTJ_02428
Operon
DOOR ID:
1092586
ABTJ_02426,
ABTJ_02427,
ABTJ_02428
View Structure
6
3064041-3064191
(+)
FMN
3064281-3064941 (+)
ABTJ_02990
ABTJ_02990
Single gene
DOOR ID:
3791429
ABTJ_02990
View Structure
7
3497108-3497174
(-)
fluoride
3496602-3496983 (-)
ABTJ_03389
ABTJ_03389
Single gene
DOOR ID:
3791601
ABTJ_03389
View Structure
8
3637464-3637598
(+)
TPP
3637687-3639565 (+)
ABTJ_03523
ABTJ_03523
Operon
DOOR ID:
1092774
ABTJ_03523,
ABTJ_03524,
ABTJ_03525
View Structure
Genome:
Acinetobacter baumannii MDR-TJ
(
NC_017847.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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