About
Search
Advanced Search
Genomes
Predict
About us
S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
228336-228450
(-)
FMN
227101-228298 (-)
MYY_0251
MYY_0251
Operon
DOOR ID:
1376958
MYY_0251,
MYY_0250,
MYY_0249,
MYY_0248
View Structure
2
448401-448489
(+)
glycine
448579-449896 (+)
MYY_0479
MYY_0479
Single gene
DOOR ID:
3781836
MYY_0479
View Structure
3
528162-528396
(+)
FMN
528545-529124 (+)
MYY_0557
MYY_0557
Operon
DOOR ID:
1377022
MYY_0560,
MYY_0559,
MYY_0558,
MYY_0557
View Structure
4
731636-731724
(+)
TPP
731939-732608 (+)
MYY_0752
MYY_0752
Single gene
DOOR ID:
3781935
MYY_0752
View Structure
5
734467-734555
(+)
TPP
734816-735377 (+)
MYY_0755
MYY_0755
Operon
DOOR ID:
1377071
MYY_0757,
MYY_0756,
MYY_0755
View Structure
6
741159-741257
(-)
TPP
740283-741075 (-)
MYY_0762
MYY_0762
Single gene
DOOR ID:
3781936
MYY_0762
View Structure
7
1042666-1042762
(+)
preQ1-II
1043368-1043441 (+)
MYY_t55
MYY_t55
Single gene
DOOR ID:
3782446
MYY_t55
View Structure
8
1711627-1711722
(+)
purine
1712121-1712703 (+)
MYY_1742
MYY_1742
Operon
DOOR ID:
1377289
MYY_1743,
MYY_1742
View Structure
9
2106800-2106902
(-)
TPP
2106438-2106729 (-)
MYY_2123
MYY_2123
Operon
DOOR ID:
1377364
MYY_2120,
MYY_2121,
MYY_2122,
MYY_2123
View Structure
Genome:
Streptococcus pneumoniae ST556
(
NC_017769.1
);
Phylum:
Firmicutes
a:10:{i:0;a:18:{i:0;s:5:"S.No.";i:1;s:9:"Genome_ID";i:2;s:11:"Genome_Name";i:3;s:13:"Taxonomy_name";i:4;s:6:"Tax_ID";i:5;s:19:"Riboswitch_Location";i:6;s:17:"Riboswitch_strand";i:7;s:16:"Riboswitch_class";i:8;s:14:"Tandem_Aptamer";i:9;s:24:"Downstream_gene_location";i:10;s:11:"Gene_Strand";i:11;s:20:"Downstream_gene_name";i:12;s:24:"Gene_product_description";i:13;s:9:"Locus_tag";i:14;s:25:"Single_gene/within_operon";i:15;s:9:"Operon_ID";i:16;s:14:"Operon_details";i:17;s:22:"Biological_process[GO]";}i:1;a:19:{i:0;i:1;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"228336-228450";i:6;s:1:"-";i:7;s:3:"FMN";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"227101-228298";i:10;s:1:"-";i:11;s:8:"MYY_0251";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_0251";i:14;s:6:"Operon";i:15;s:7:"1376958";i:16;s:35:"MYY_0251;MYY_0250;MYY_0249;MYY_0248";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:2;a:19:{i:0;i:2;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"448401-448489";i:6;s:1:"+";i:7;s:7:"glycine";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"448579-449896";i:10;s:1:"+";i:11;s:8:"MYY_0479";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_0479";i:14;s:11:"Single gene";i:15;s:7:"3781836";i:16;s:8:"MYY_0479";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:3;a:19:{i:0;i:3;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"528162-528396";i:6;s:1:"+";i:7;s:3:"FMN";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"528545-529124";i:10;s:1:"+";i:11;s:8:"MYY_0557";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_0557";i:14;s:6:"Operon";i:15;s:7:"1377022";i:16;s:35:"MYY_0560;MYY_0559;MYY_0558;MYY_0557";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:4;a:19:{i:0;i:4;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"731636-731724";i:6;s:1:"+";i:7;s:3:"TPP";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"731939-732608";i:10;s:1:"+";i:11;s:8:"MYY_0752";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_0752";i:14;s:11:"Single gene";i:15;s:7:"3781935";i:16;s:8:"MYY_0752";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:5;a:19:{i:0;i:5;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"734467-734555";i:6;s:1:"+";i:7;s:3:"TPP";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"734816-735377";i:10;s:1:"+";i:11;s:8:"MYY_0755";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_0755";i:14;s:6:"Operon";i:15;s:7:"1377071";i:16;s:26:"MYY_0757;MYY_0756;MYY_0755";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:6;a:19:{i:0;i:6;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"741159-741257";i:6;s:1:"-";i:7;s:3:"TPP";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"740283-741075";i:10;s:1:"-";i:11;s:8:"MYY_0762";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_0762";i:14;s:11:"Single gene";i:15;s:7:"3781936";i:16;s:8:"MYY_0762";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:7;a:19:{i:0;i:7;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:15:"1042666-1042762";i:6;s:1:"+";i:7;s:8:"preQ1-II";i:8;s:0:"";i:9;s:15:"1043368-1043441";i:10;s:1:"+";i:11;s:7:"MYY_t55";i:12;s:0:"";i:13;s:7:"MYY_t55";i:14;s:11:"Single gene";i:15;s:7:"3782446";i:16;s:7:"MYY_t55";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:8;a:19:{i:0;i:8;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:15:"1711627-1711722";i:6;s:1:"+";i:7;s:6:"purine";i:8;s:0:"";i:9;s:15:"1712121-1712703";i:10;s:1:"+";i:11;s:8:"MYY_1742";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_1742";i:14;s:6:"Operon";i:15;s:7:"1377289";i:16;s:17:"MYY_1743;MYY_1742";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}i:9;a:19:{i:0;i:9;i:1;s:11:"NC_017769.1";i:2;s:31:"Streptococcus pneumoniae ST556 ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:15:"2106800-2106902";i:6;s:1:"-";i:7;s:3:"TPP";i:8;s:0:"";i:9;s:15:"2106438-2106729";i:10;s:1:"-";i:11;s:8:"MYY_2123";i:12;s:0:"";i:13;s:8:"MYY_2123";i:14;s:6:"Operon";i:15;s:7:"1377364";i:16;s:35:"MYY_2120;MYY_2121;MYY_2122;MYY_2123";i:17;s:0:"";i:18;s:15:"View Structure ";}}