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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
157526-157681
(+)
glmS
157872-159675 (+)
H9401_0151
H9401_0151
Single gene
DOOR ID:
3764906
H9401_0151
View Structure
2
177158-177272
(-)
SAM
176259-177072 (-)
H9401_0169
H9401_0169
Operon
DOOR ID:
1084075
H9401_0166,
H9401_0167,
H9401_0168,
H9401_0169
View Structure
3
185582-185687
(+)
SAM
185817-186741 (+)
H9401_0178
H9401_0178
Operon
DOOR ID:
1084077
H9401_0178,
H9401_0179,
H9401_0180,
H9401_0181,
H9401_0182
View Structure
4
197078-197184
(-)
SAM
195304-196945 (-)
H9401_0188
H9401_0188
Single gene
DOOR ID:
3764925
H9401_0188
View Structure
5
261105-261206
(+)
purine
261362-262910 (+)
H9401_0253
H9401_0253
Single gene
DOOR ID:
3764956
H9401_0253
View Structure
6
263065-263166
(+)
purine
263294-264620 (+)
H9401_0254
H9401_0254
Single gene
DOOR ID:
3764957
H9401_0254
View Structure
7
285823-285924
(+)
purine
286033-286519 (+)
H9401_0265
H9401_0265
Operon
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1084094
H9401_0265,
H9401_0266,
H9401_0267,
H9401_0268,
H9401_0269,
H9401_0270,
H9401_0271,
H9401_0272,
H9401_0273,
H9401_0274,
H9401_0275,
H9401_0276
View Structure
8
311097-311203
(+)
SAM
311326-312346 (+)
H9401_0288
H9401_0288
Operon
DOOR ID:
1084097
H9401_0288,
H9401_0289,
H9401_0290
View Structure
9
332746-332847
(-)
purine
331347-332544 (-)
H9401_0308
H9401_0308
Single gene
DOOR ID:
3764976
H9401_0308
View Structure
10
361508-361620
(-)
SAM
360788-361472 (-)
H9401_0338
H9401_0338
Single gene
DOOR ID:
3764992
H9401_0338
View Structure
11
384404-384513
(+)
TPP
384585-385392 (+)
H9401_0355
H9401_0355
Operon
DOOR ID:
1084109
H9401_0355,
H9401_0356
View Structure
12
387782-387866
(+)
c-di-GMP-I
388007-389747 (+)
H9401_0358
H9401_0358
single gene
DOOR ID:
3765005
H9401_0358
View Structure
13
389809-389911
(+)
TPP
390010-390331 (+)
H9401_0359
H9401_0359
Operon
DOOR ID:
1084110
H9401_0359,
H9401_0360,
H9401_0361,
H9401_0362
View Structure
14
743233-743345
(+)
TPP
743593-744289 (+)
H9401_0694
H9401_0694
Single gene
DOOR ID:
3765153
H9401_0694
View Structure
15
743406-743509
(+)
TPP
743593-744289 (+)
H9401_0694
H9401_0694
Single gene
DOOR ID:
3765153
H9401_0694
View Structure
16
751406-751553
(+)
ydaO-yuaA
752034-752280 (+)
H9401_0704
H9401_0704
Operon
DOOR ID:
1084180
H9401_0704,
H9401_0705
View Structure
17
752542-752687
(+)
ydaO-yuaA
752987-754655 (+)
H9401_0706
H9401_0706
Operon
DOOR ID:
1084181
H9401_0706,
H9401_0707,
H9401_0708,
H9401_0709
View Structure
18
846396-846577
(-)
lysine
844825-846196 (-)
H9401_0808
H9401_0808
Operon
DOOR ID:
1084201
H9401_0807,
H9401_0808
View Structure
19
1259850-1260014
(-)
yybP-ykoY
1258963-1259827 (-)
H9401_1237
H9401_1237
Single gene
DOOR ID:
3765422
H9401_1237
View Structure
20
1289617-1289660
(+)
PreQ1
1289744-1290416 (+)
H9401_1273
H9401_1273
Operon
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1084290
H9401_1273,
H9401_1274,
H9401_1275,
H9401_1276
View Structure
21
1351709-1351890
(+)
lysine
1352037-1353387 (+)
H9401_1351
H9401_1351
Single gene
DOOR ID:
3765475
H9401_1351
View Structure
22
1353503-1353611
(+)
SAM
1353709-1353826 (+)
H9401_1353
H9401_1353
Operon
DOOR ID:
1084301
H9401_1352,
H9401_1353
View Structure
23
1366196-1366301
(+)
SAM
1366372-1367713 (+)
H9401_1366
H9401_1366
Single gene
DOOR ID:
3765478
H9401_1366
View Structure
24
1413410-1413549
(+)
FMN
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H9401_1411
H9401_1411
Single gene
DOOR ID:
3765508
H9401_1411
View Structure
25
1488355-1488456
(+)
purine
1488563-1489157 (+)
H9401_1498
H9401_1498
Operon
DOOR ID:
1084328
H9401_1497,
H9401_1498,
H9401_1499
View Structure
26
1501184-1501347
(+)
ykoK
1501713-1502418 (+)
H9401_1511
H9401_1511
Single gene
DOOR ID:
3765547
H9401_1511
View Structure
27
1533181-1533225
(+)
PreQ1
1533231-1533717 (+)
H9401_1531
H9401_1531
Single gene
DOOR ID:
3765556
H9401_1531
View Structure
28
1687419-1687605
(-)
lysine
1685989-1687219 (-)
H9401_1710
H9401_1710
Single gene
DOOR ID:
3765622
H9401_1710
View Structure
29
1758869-1759015
(+)
ydaO-yuaA
1759158-1760256 (+)
H9401_1782
H9401_1782
Operon
DOOR ID:
1084379
H9401_1782,
H9401_1783
View Structure
30
2211895-2212014
(-)
glycine
2210419-2211787 (-)
H9401_2261
H9401_2261
Single gene
DOOR ID:
3765906
H9401_2261
View Structure
31
2423879-2423984
(+)
TPP
2424080-2424797 (+)
H9401_2488
H9401_2488
Single gene
DOOR ID:
3766037
H9401_2488
View Structure
32
2449648-2449763
(+)
SAM
2449902-2450451 (+)
H9401_2515
H9401_2515
Operon
DOOR ID:
1084509
H9401_2515,
H9401_2516,
H9401_2517
View Structure
33
2824257-2824449
(+)
lysine
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H9401_2936
H9401_2936
Single gene
DOOR ID:
3766255
H9401_2936
View Structure
34
2943737-2943838
(-)
SAM
2942442-2943672 (-)
H9401_3059
H9401_3059
Single gene
DOOR ID:
3766324
H9401_3059
View Structure
35
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(-)
SAM
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H9401_3198
H9401_3198
Single gene
DOOR ID:
3766400
H9401_3198
View Structure
36
3127490-3127631
(+)
ydaO-yuaA
3127927-3128683 (-)
H9401_3247
H9401_3247
Operon
DOOR ID:
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H9401_3247,
H9401_3248
View Structure
37
3595636-3595737
(-)
purine
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H9401_3744
H9401_3744
Single gene
DOOR ID:
3766663
H9401_3744
View Structure
38
3849498-3849686
(+)
cobalamin
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H9401_4021
H9401_4021
Single gene
DOOR ID:
3766752
H9401_4021
View Structure
39
3880870-3881011
(-)
SAM
3879597-3880779 (-)
H9401_4052
H9401_4052
Operon
DOOR ID:
1084807
H9401_4051,
H9401_4052
View Structure
40
3883204-3883311
(+)
SAM
3883375-3884620 (+)
H9401_4055
H9401_4055
Operon
DOOR ID:
1084808
H9401_4055,
H9401_4056,
H9401_4057,
H9401_4058
View Structure
41
3944160-3944303
(+)
FMN
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H9401_4131
H9401_4131
Operon
DOOR ID:
1084820
H9401_4131,
H9401_4132,
H9401_4133,
H9401_4134
View Structure
42
3953702-3953764
(-)
glutamine
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H9401_4140
H9401_4140
Operon
DOOR ID:
1084821
H9401_4136,
H9401_4137,
H9401_4138,
H9401_4139,
H9401_4140,
H9401_4141
View Structure
43
4064239-4064348
(-)
SAM
4062335-4064168 (-)
H9401_4272
H9401_4272
Operon
DOOR ID:
1084844
H9401_4269,
H9401_4270,
H9401_4271,
H9401_4272
View Structure
44
4064551-4064660
(+)
SAM
4064754-4065867 (+)
H9401_4273
H9401_4273
Operon
DOOR ID:
1084845
H9401_4273,
H9401_4274
View Structure
45
4544935-4545056
(-)
SAM
4543565-4544765 (-)
H9401_4795
H9401_4795
Single gene
DOOR ID:
3767085
H9401_4795
View Structure
46
4580794-4580895
(+)
TPP
4580960-4581650 (+)
H9401_4837
H9401_4837
Single gene
DOOR ID:
3767112
H9401_4837
View Structure
47
4731313-4731420
(-)
SAM
4729988-4731014 (-)
H9401_4985
H9401_4985
Operon
DOOR ID:
1084996
H9401_4984,
H9401_4985
View Structure
48
4815178-4815237
(+)
fluoride
4815261-4815696 (+)
H9401_5073
H9401_5073
Operon
DOOR ID:
1085017
H9401_5073,
H9401_5074
View Structure
49
4944829-4944944
(-)
TPP
4942955-4944716 (-)
H9401_5209
H9401_5209
Single gene
DOOR ID:
3767287
H9401_5209
View Structure
50
5131892-5131997
(-)
SAM
5130500-5131799 (-)
H9401_5398
H9401_5398
Operon
DOOR ID:
1085083
H9401_5397,
H9401_5398
View Structure
Genome:
Bacillus anthracis str. H9401
(
NC_017729.1
);
Phylum:
Firmicutes
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