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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
699045-699193
(+)
FMN
699296-699950 (+)
EcDH1_0659
EcDH1_0659
Single gene
DOOR ID:
3723059
EcDH1_0659
View Structure
2
1691427-1691523
(+)
TPP
1691557-1692346 (+)
EcDH1_1553
EcDH1_1553
Operon
DOOR ID:
1074002
EcDH1_1553,
EcDH1_1554,
EcDH1_1555,
EcDH1_1556
View Structure
3
1972921-1973022
(-)
yybP-ykoY
1972223-1972790 (-)
EcDH1_1822
EcDH1_1822
Single gene
DOOR ID:
3723438
EcDH1_1822
View Structure
4
3064063-3064207
(-)
MOCO
3062551-3063064 (-)
EcDH1_2860
EcDH1_2860
Operon
DOOR ID:
1074235
EcDH1_2857,
EcDH1_2858,
EcDH1_2859,
EcDH1_2860,
EcDH1_2861
View Structure
5
3795767-3795866
(+)
TPP
3795896-3796880 (+)
EcDH1_3531
EcDH1_3531
Operon
DOOR ID:
1074379
EcDH1_3531,
EcDH1_3532,
EcDH1_3533
View Structure
6
4046274-4046389
(-)
Mg sensor
4043483-4046180 (-)
EcDH1_3752
EcDH1_3752
Single gene
DOOR ID:
3724174
EcDH1_3752
View Structure
7
4137724-4137770
(-)
mini-ykkC
4136858-4137392 (+)
EcDH1_3841
EcDH1_3841
Operon
DOOR ID:
1074444
EcDH1_3836,
EcDH1_3837,
EcDH1_3838,
EcDH1_3839,
EcDH1_3840,
EcDH1_3841
View Structure
8
4280949-4281145
(+)
lysine
4281236-4282586 (+)
EcDH1_3973
EcDH1_3973
Single gene
DOOR ID:
3724272
EcDH1_3973
View Structure
9
4318190-4318290
(+)
TPP
4318370-4320266 (+)
EcDH1_4000
EcDH1_4000
Operon
DOOR ID:
1074475
EcDH1_4000,
EcDH1_4001,
EcDH1_4002,
EcDH1_4003,
EcDH1_4004,
EcDH1_4005
View Structure
10
4350896-4351086
(-)
cobalamin
4348986-4350831 (-)
EcDH1_4020
EcDH1_4020
Operon
DOOR ID:
1074480
EcDH1_4019,
EcDH1_4020
View Structure
Genome:
Escherichia coli DH1
(
NC_017625.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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