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Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
15938-16036
(+)
SAM
16094-17063 (+)
aroB
SAT0131_00014
Single gene
DOOR ID:
3603480
SAT0131_00014
(aroB)
View Structure
2
417921-418023
(+)
purine
418253-418832 (+)
ackA
SAT0131_00420
Operon
DOOR ID:
1035198
SAT0131_00420
(ackA)
,
SAT0131_00421,
SAT0131_00422
(tpx)
,
SAT0131_00424
View Structure
3
779162-779208
(-)
PreQ1
778323-778992 (-)
SAT0131_00782
SAT0131_00782
Operon
DOOR ID:
1035270
SAT0131_00780
(ldh1)
,
SAT0131_00781,
SAT0131_00782
View Structure
4
902384-902487
(+)
SAM
902575-903601 (+)
agrC
SAT0131_00912
Operon
DOOR ID:
1035299
SAT0131_00912
(agrC)
,
SAT0131_00913
(agrA)
,
SAT0131_00914
View Structure
5
960491-960581
(+)
preQ1-II
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SAT0131_00987
SAT0131_00987
Single gene
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3603811
SAT0131_00987
View Structure
6
1038280-1038386
(+)
yybP-ykoY
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SAT0131_01056
SAT0131_01056
Single gene
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3603832
SAT0131_01056
View Structure
7
1101396-1101496
(-)
TPP
1100743-1101319 (-)
SAT0131_01114
SAT0131_01114
Operon
DOOR ID:
1035338
SAT0131_01112,
SAT0131_01113,
SAT0131_01114
View Structure
8
1448301-1448476
(+)
lysine
1448557-1449763 (+)
bioD
SAT0131_01467
Operon
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1035403
SAT0131_01467
(bioD)
,
SAT0131_01468,
SAT0131_01469,
SAT0131_01470,
SAT0131_01472,
SAT0131_01473,
SAT0131_01474
(bcr)
,
SAT0131_01475
View Structure
9
1573819-1573953
(-)
FMN
1573211-1573757 (-)
SAT0131_01574
SAT0131_01574
Single gene
DOOR ID:
3603955
SAT0131_01574
View Structure
10
1625079-1625176
(-)
glycine
1623912-1625004 (-)
SAT0131_01630
SAT0131_01630
Operon
DOOR ID:
1035437
SAT0131_01628,
SAT0131_01629,
SAT0131_01630,
SAT0131_01631
(tmk)
View Structure
11
1761258-1761433
(-)
lysine
1759619-1761113 (-)
argS
SAT0131_01784
Single gene
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3603983
SAT0131_01784
(argS)
View Structure
12
1879658-1879793
(-)
FMN
1878487-1879531 (-)
SAT0131_01885
SAT0131_01885
Operon
DOOR ID:
1035485
SAT0131_01882,
SAT0131_01883,
SAT0131_01884,
SAT0131_01885
View Structure
13
1896437-1896547
(-)
SAM
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SAT0131_01904
SAT0131_01904
Operon
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1035489
SAT0131_01903,
SAT0131_01904
View Structure
14
2211077-2211179
(-)
TPP
2210307-2210997 (-)
SAT0131_02254
SAT0131_02254
Operon
DOOR ID:
1035556
SAT0131_02249
(cdr)
,
SAT0131_02250,
SAT0131_02252,
SAT0131_02253
(clpB)
,
SAT0131_02254,
SAT0131_02255,
SAT0131_02256
View Structure
15
2269206-2269422
(-)
glmS
2267198-2269004 (-)
SAT0131_02318
SAT0131_02318
Single gene
DOOR ID:
3604114
SAT0131_02318
View Structure
16
2445695-2445790
(-)
SAM
2444304-2445618 (-)
SAT0131_02509
SAT0131_02509
Operon
DOOR ID:
1035603
SAT0131_02508,
SAT0131_02509
View Structure
Genome:
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(
NC_017347.1
);
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Firmicutes
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