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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
15956-16054
(+)
SAM
16113-17082 (+)
ECTR2_12
ECTR2_12
Single gene
DOOR ID:
3602303
ECTR2_12
View Structure
2
395082-395184
(+)
purine
395414-395993 (+)
xpt
ECTR2_347
Operon
DOOR ID:
1034702
ECTR2_347
(xpt)
,
ECTR2_348
(pbuX)
,
ECTR2_349
(guaB)
,
ECTR2_350
(guaA)
View Structure
3
726571-726617
(-)
PreQ1
725732-726401 (-)
ECTR2_663
ECTR2_663
Operon
DOOR ID:
1034767
ECTR2_661
(queE)
,
ECTR2_662
(queD)
,
ECTR2_663
View Structure
4
833640-833743
(+)
SAM
833831-834857 (+)
ECTR2_764
ECTR2_764
Operon
DOOR ID:
1034788
ECTR2_764,
ECTR2_765,
ECTR2_766
View Structure
5
876854-876944
(+)
preQ1-II
878066-878327 (+)
ECTR2_811
ECTR2_811
Single gene
DOOR ID:
3602635
ECTR2_811
View Structure
6
954322-954428
(+)
yybP-ykoY
954509-955307 (+)
ECTR2_876
ECTR2_876
Single gene
DOOR ID:
3602660
ECTR2_876
View Structure
7
1014394-1014494
(-)
TPP
1013741-1014317 (-)
ECTR2_933
ECTR2_933
Operon
DOOR ID:
1034820
ECTR2_931,
ECTR2_932,
ECTR2_933
View Structure
8
1357943-1358118
(+)
lysine
1358199-1359405 (+)
ECTR2_1250
ECTR2_1250
Operon
DOOR ID:
1034881
ECTR2_1250,
ECTR2_1251
(asd)
,
ECTR2_1252
(dapA)
,
ECTR2_1253
(dapB)
,
ECTR2_1254
View Structure
9
1482338-1482472
(-)
FMN
1481730-1482276 (-)
ECTR2_1336
ECTR2_1336
Single gene
DOOR ID:
3602844
ECTR2_1336
View Structure
10
1531284-1531381
(-)
glycine
1530117-1531209 (-)
gcvT
ECTR2_1388
Operon
DOOR ID:
1034913
ECTR2_1386,
ECTR2_1387,
ECTR2_1388
(gcvT)
View Structure
11
1661448-1661623
(-)
lysine
1659809-1661303 (-)
ECTR2_1522
ECTR2_1522
Single gene
DOOR ID:
3602888
ECTR2_1522
View Structure
12
1774654-1774789
(-)
FMN
1773483-1774527 (-)
ribD
ECTR2_1608
Operon
DOOR ID:
1034960
ECTR2_1605
(ribH)
,
ECTR2_1606
(ribB)
,
ECTR2_1607
(ribE)
,
ECTR2_1608
(ribD)
View Structure
13
1790726-1790837
(-)
SAM
1789423-1790620 (-)
metK
ECTR2_1625
Single gene
DOOR ID:
3602945
ECTR2_1625
(metK)
View Structure
14
2079653-2079755
(-)
TPP
2078883-2079573 (-)
ECTR2_1950
ECTR2_1950
Operon
DOOR ID:
1035022
ECTR2_1947
(thiE)
,
ECTR2_1948,
ECTR2_1949
(thiD)
,
ECTR2_1950
View Structure
15
2134980-2135196
(-)
glmS
2132972-2134778 (-)
glmS
ECTR2_2008
Single gene
DOOR ID:
3603082
ECTR2_2008
(glmS)
View Structure
16
2304501-2304596
(-)
SAM
2303110-2304424 (-)
ECTR2_2185
ECTR2_2185
Single gene
DOOR ID:
3603156
ECTR2_2185
View Structure
Genome:
Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2
(
NC_017343.1
);
Phylum:
Firmicutes
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