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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
15952-16050
(+)
SAM
16109-17078 (+)
SAOV_0012
SAOV_0012
Single gene
DOOR ID:
3596429
SAOV_0012
View Structure
2
429415-429517
(+)
purine
429747-430326 (+)
xpt
SAOV_0410
Operon
DOOR ID:
1349850
SAOV_0410
(xpt)
,
SAOV_0411
(pbuX)
,
SAOV_0412
(guaB)
,
SAOV_0413
(guaA)
View Structure
3
772254-772300
(-)
PreQ1
771415-772084 (-)
SAOV_0746c
SAOV_0746c
Operon
DOOR ID:
1349918
SAOV_0744c,
SAOV_0745c,
SAOV_0746c
View Structure
4
879571-879674
(+)
SAM
879762-880788 (+)
SAOV_0854
SAOV_0854
Operon
DOOR ID:
1349938
SAOV_0854,
SAOV_0855,
SAOV_0856
View Structure
5
921713-921803
(+)
preQ1-II
922809-923187 (+)
SAOV_0901
SAOV_0901
Single gene
DOOR ID:
3596777
SAOV_0901
View Structure
6
999621-999727
(+)
yybP-ykoY
999802-1000606 (+)
SAOV_0965
SAOV_0965
Single gene
DOOR ID:
3596802
SAOV_0965
View Structure
7
1059613-1059713
(-)
TPP
1058960-1059536 (-)
SAOV_1022c
SAOV_1022c
Single gene
DOOR ID:
3596828
SAOV_1022c
View Structure
8
1444143-1444318
(+)
lysine
1444399-1445605 (+)
lysC
SAOV_1402
Operon
DOOR ID:
1350037
SAOV_1402
(lysC)
,
SAOV_1403
(asd)
,
SAOV_1404
(dapA)
,
SAOV_1405
(dapB)
,
SAOV_1406
(dapD)
View Structure
9
1566342-1566476
(-)
FMN
1565734-1566280 (-)
SAOV_1491
SAOV_1491
Single gene
DOOR ID:
3597010
SAOV_1491
View Structure
10
1612306-1612402
(-)
glycine
1611139-1612231 (-)
gcvT
SAOV_1537
Operon
DOOR ID:
1350070
SAOV_1535,
SAOV_1536,
SAOV_1537
(gcvT)
View Structure
11
1742707-1742882
(-)
lysine
1741067-1742561 (-)
lysP
SAOV_1670
Single gene
DOOR ID:
3597045
SAOV_1670
(lysP)
View Structure
12
1855802-1855937
(-)
FMN
1854631-1855663 (-)
ribD
SAOV_1754
Operon
DOOR ID:
1350117
SAOV_1751
(ribH)
,
SAOV_1752
(ribA)
,
SAOV_1753
(ribE)
,
SAOV_1754
(ribD)
View Structure
13
1870800-1870910
(-)
SAM
1869500-1870796 (-)
SAOV_1771
SAOV_1771
Single gene
DOOR ID:
3597098
SAOV_1771
View Structure
14
2186429-2186531
(-)
TPP
2185659-2186349 (-)
tenA
SAOV_2135c
Operon
DOOR ID:
1350190
SAOV_2132c,
SAOV_2133c,
SAOV_2134c
(thiD2)
,
SAOV_2135c
(tenA)
View Structure
15
2247565-2247781
(-)
glmS
2245557-2247363 (-)
SAOV_2193c
SAOV_2193c
Single gene
DOOR ID:
3597234
SAOV_2193c
View Structure
16
2411920-2412015
(-)
SAM
2410547-2411843 (-)
SAOV_2366c
SAOV_2366c
Single gene
DOOR ID:
3597307
SAOV_2366c
View Structure
Genome:
Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133
(
NC_017337.1
);
Phylum:
Firmicutes
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