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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
321999-322165
(+)
ykoK
322256-323873 (+)
EF62_0301
EF62_0301
Single gene
DOOR ID:
3584902
EF62_0301
View Structure
2
645223-645397
(-)
lysine
643444-645028 (-)
EF62_0616
EF62_0616
Operon
DOOR ID:
1349268
EF62_0615,
EF62_0616
View Structure
3
1153296-1153391
(+)
SMK_box
1154742-1156209 (+)
EF62_1167
EF62_1167
Operon
DOOR ID:
1349386
EF62_1167,
EF62_1168,
EF62_1169
View Structure
4
1302212-1302379
(+)
THF
1302418-1302958 (+)
EF62_1313
EF62_1313
Single gene
DOOR ID:
3585244
EF62_1313
View Structure
5
1461600-1461767
(-)
ykoK
1461279-1461531 (-)
EF62_1506
EF62_1506
Single gene
DOOR ID:
3585285
EF62_1506
View Structure
6
1464515-1464682
(-)
ykoK
1462697-1464455 (-)
EF62_1508
EF62_1508
Operon
DOOR ID:
1349452
EF62_1507,
EF62_1508
View Structure
7
1705350-1705520
(+)
ykoK
1705633-1708294 (+)
mgtA_1
EF62_1746
Single gene
DOOR ID:
3585360
EF62_1746
(mgtA_1)
View Structure
8
1769259-1769426
(+)
ykoK
1769649-1772262 (+)
mgtA_2
EF62_1803
Single gene
DOOR ID:
3585378
EF62_1803
(mgtA_2)
View Structure
9
1899785-1899904
(+)
FMN
1900035-1900641 (+)
EF62_1921
EF62_1921
Single gene
DOOR ID:
3585424
EF62_1921
View Structure
10
2000355-2000486
(-)
cobalamin
1998899-2000030 (-)
eutG
EF62_2015
Single gene
DOOR ID:
3585460
EF62_2015
(eutG)
View Structure
11
2004590-2004761
(-)
cobalamin
2003443-2004403 (-)
EF62_2020
EF62_2020
Operon
DOOR ID:
1349558
EF62_2018
(fhuB)
,
EF62_2019,
EF62_2020
View Structure
12
2414314-2414461
(-)
glmS
2412427-2414236 (-)
glmS
EF62_2451
Single gene
DOOR ID:
3585600
EF62_2451
(glmS)
View Structure
13
2541060-2541157
(-)
purine
2540323-2540905 (-)
xpt
EF62_2553
Operon
DOOR ID:
1349667
EF62_2552
(pbuX_1)
,
EF62_2553
(xpt)
View Structure
14
2670612-2670681
(-)
fluoride
2669269-2670535 (-)
EF62_2682
EF62_2682
Single gene
DOOR ID:
3585673
EF62_2682
View Structure
15
2750018-2750062
(+)
PreQ1
2750139-2751114 (+)
EF62_2755
EF62_2755
Operon
DOOR ID:
1349716
EF62_2755,
EF62_2756
View Structure
16
2818088-2818133
(-)
PreQ1
2817568-2818075 (-)
EF62_2820
EF62_2820
Single gene
DOOR ID:
3585706
EF62_2820
View Structure
17
2925039-2925129
(-)
TPP
2924370-2924934 (-)
EF62_2922
EF62_2922
Operon
DOOR ID:
1349765
EF62_2919
(tenA)
,
EF62_2920,
EF62_2921,
EF62_2922
View Structure
18
2932344-2932432
(-)
TPP
2931714-2932245 (-)
EF62_2930
EF62_2930
Operon
DOOR ID:
1349766
EF62_2927
(thiD_2)
,
EF62_2928
(thiE)
,
EF62_2929,
EF62_2930
View Structure
Genome:
Enterococcus faecalis 62
(
NC_017312.1
);
Phylum:
Firmicutes
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