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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
15887-15985
(+)
SAM
16044-17013 (+)
SAMSHR1132_00120
SAMSHR1132_00120
Single gene
DOOR ID:
3444563
SAMSHR1132_00120
View Structure
2
412179-412281
(+)
purine
412514-413093 (+)
SAMSHR1132_03590
SAMSHR1132_03590
Operon
DOOR ID:
1334107
SAMSHR1132_03620,
SAMSHR1132_03610,
SAMSHR1132_03600,
SAMSHR1132_03590
View Structure
3
744639-744685
(-)
PreQ1
743797-744466 (-)
SAMSHR1132_06570
SAMSHR1132_06570
Operon
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1334177
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SAMSHR1132_06560,
SAMSHR1132_06570
View Structure
4
854859-854962
(+)
SAM
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SAMSHR1132_07610
SAMSHR1132_07610
Operon
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1334197
SAMSHR1132_07610,
SAMSHR1132_07620,
SAMSHR1132_07630
View Structure
5
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(+)
preQ1-II
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SAMSHR1132_08070
SAMSHR1132_08070
Single gene
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3444883
SAMSHR1132_08070
View Structure
6
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(+)
yybP-ykoY
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SAMSHR1132_08680
SAMSHR1132_08680
Single gene
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3444906
SAMSHR1132_08680
View Structure
7
1034561-1034661
(-)
TPP
1033908-1034484 (-)
SAMSHR1132_09250
SAMSHR1132_09250
Operon
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SAMSHR1132_09230,
SAMSHR1132_09240,
SAMSHR1132_09250
View Structure
8
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(+)
lysine
1378129-1379335 (+)
SAMSHR1132_12340
SAMSHR1132_12340
Operon
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1334287
SAMSHR1132_12340,
SAMSHR1132_12350,
SAMSHR1132_12360,
SAMSHR1132_12370,
SAMSHR1132_12380
View Structure
9
1486356-1486490
(-)
FMN
1485748-1486294 (-)
SAMSHR1132_13230
SAMSHR1132_13230
Single gene
DOOR ID:
3445082
SAMSHR1132_13230
View Structure
10
1539551-1539647
(-)
glycine
1538385-1539477 (-)
SAMSHR1132_13770
SAMSHR1132_13770
Operon
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1334323
SAMSHR1132_13750,
SAMSHR1132_13760,
SAMSHR1132_13770
View Structure
11
1667796-1667971
(-)
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SAMSHR1132_15090
SAMSHR1132_15090
Single gene
DOOR ID:
3445121
SAMSHR1132_15090
View Structure
12
1798226-1798361
(-)
FMN
1797054-1798098 (-)
SAMSHR1132_16180
SAMSHR1132_16180
Operon
DOOR ID:
1334373
SAMSHR1132_16150,
SAMSHR1132_16160,
SAMSHR1132_16170,
SAMSHR1132_16180
View Structure
13
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(-)
SAM
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SAMSHR1132_16350
SAMSHR1132_16350
Single gene
DOOR ID:
3445177
SAMSHR1132_16350
View Structure
14
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(-)
TPP
2095016-2095703 (-)
SAMSHR1132_19180
SAMSHR1132_19180
Operon
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1334434
SAMSHR1132_19150,
SAMSHR1132_19160,
SAMSHR1132_19170,
SAMSHR1132_19180
View Structure
15
2160332-2160548
(-)
glmS
2158323-2160129 (-)
SAMSHR1132_19870
SAMSHR1132_19870
Single gene
DOOR ID:
3445308
SAMSHR1132_19870
View Structure
16
2326825-2326920
(-)
SAM
2325436-2326750 (-)
SAMSHR1132_21510
SAMSHR1132_21510
Single gene
DOOR ID:
3445373
SAMSHR1132_21510
View Structure
Genome:
Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132
(
NC_016941.1
);
Phylum:
Firmicutes
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