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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
164056-164285
(-)
FMN
163212-163866 (-)
Sbal678_0142
Sbal678_0142
Single gene
DOOR ID:
3424015
Sbal678_0142
View Structure
2
326211-326344
(+)
MOCO
327407-327884 (+)
Sbal678_0293
Sbal678_0293
Operon
DOOR ID:
976452
Sbal678_0292,
Sbal678_0293,
Sbal678_0294,
Sbal678_0295,
Sbal678_0296,
Sbal678_0297,
Sbal678_0298
View Structure
3
1022644-1022772
(+)
glycine
1023022-1024381 (+)
Sbal678_0891
Sbal678_0891
Operon
DOOR ID:
976558
Sbal678_0891,
Sbal678_0892,
Sbal678_0893
View Structure
4
1204461-1204627
(+)
cobalamin
1204726-1205620 (+)
Sbal678_1035
Sbal678_1035
Operon
DOOR ID:
976587
Sbal678_1035,
Sbal678_1036,
Sbal678_1037,
Sbal678_1038,
Sbal678_1039,
Sbal678_1040,
Sbal678_1041,
Sbal678_1042,
Sbal678_1043
View Structure
5
2205489-2205614
(+)
TPP
2205668-2207900 (+)
Sbal678_1880
Sbal678_1880
Operon
DOOR ID:
976768
Sbal678_1880,
Sbal678_1881,
Sbal678_1882,
Sbal678_1883,
Sbal678_1884,
Sbal678_1885,
Sbal678_1886,
Sbal678_1887
View Structure
6
2835597-2835695
(-)
TPP
2833271-2835395 (-)
Sbal678_2440
Sbal678_2440
Operon
DOOR ID:
976874
Sbal678_2433,
Sbal678_2434,
Sbal678_2435,
Sbal678_2436,
Sbal678_2437,
Sbal678_2438,
Sbal678_2439,
Sbal678_2440
View Structure
7
3474961-3475009
(-)
mini-ykkC
3474630-3474945 (-)
Sbal678_2980
Sbal678_2980
Operon
DOOR ID:
976985
Sbal678_2979,
Sbal678_2980
View Structure
8
3507056-3507252
(-)
lysine
3505407-3506967 (-)
Sbal678_3003
Sbal678_3003
Single gene
DOOR ID:
3424858
Sbal678_3003
View Structure
9
3754838-3754926
(-)
c-di-GMP-I
3752116-3754723 (-)
Sbal678_3243
Sbal678_3243
single gene
DOOR ID:
3424900
Sbal678_3243
View Structure
10
4172491-4172590
(-)
c-di-GMP-I
4170922-4172368 (-)
Sbal678_3612
Sbal678_3612
single gene
DOOR ID:
3424997
Sbal678_3612
View Structure
11
4172815-4172918
(+)
yybP-ykoY
4173001-4173556 (+)
Sbal678_3613
Sbal678_3613
Single gene
DOOR ID:
3424998
Sbal678_3613
View Structure
12
4389134-4389367
(-)
cobalamin
4387063-4389025 (-)
Sbal678_3796
Sbal678_3796
Single gene
DOOR ID:
3425055
Sbal678_3796
View Structure
13
4470740-4470914
(-)
lysine
4469233-4470589 (-)
Sbal678_3870
Sbal678_3870
Operon
DOOR ID:
977168
Sbal678_3869,
Sbal678_3870
View Structure
Genome:
Shewanella baltica OS678
(
NC_016901.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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