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Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
163169-163324
(+)
glmS
163515-165318 (+)
BCN_0158
BCN_0158
Operon
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1211174
BCN_0158,
BCN_0157
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2
182800-182914
(-)
SAM
181900-182713 (-)
BCN_0174
BCN_0174
Operon
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1211177
BCN_0174,
BCN_0173,
BCN_0172
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3
191235-191340
(+)
SAM
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BCN_0183
BCN_0183
Operon
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1211179
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BCN_0184,
BCN_0183
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4
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(-)
SAM
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BCN_0191
BCN_0191
Single gene
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BCN_0191
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5
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(+)
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BCN_0262
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6
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(+)
purine
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BCN_0263
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7
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(+)
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BCN_0284
BCN_0284
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BCN_0284
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8
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(+)
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BCN_0308
BCN_0308
Operon
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(-)
purine
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BCN_0328
BCN_0328
Single gene
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BCN_0328
View Structure
10
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(-)
SAM
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BCN_0378
BCN_0378
Single gene
DOOR ID:
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BCN_0378
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11
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(+)
TPP
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BCN_0408
BCN_0408
Operon
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BCN_0408
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12
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(+)
c-di-GMP-I
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BCN_0413
BCN_0413
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BCN_0413
View Structure
13
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(+)
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BCN_0414
BCN_0414
Operon
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BCN_0414
View Structure
14
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(+)
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BCN_0703
BCN_0703
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(+)
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BCN_0703
Operon
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BCN_0703
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16
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(+)
ydaO-yuaA
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BCN_0713
BCN_0713
Operon
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BCN_0713
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(+)
ydaO-yuaA
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BCN_0716
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BCN_0731
Operon
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19
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(-)
lysine
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BCN_0848
BCN_0848
Operon
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(-)
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BCN_1283
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BCN_1283
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21
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(+)
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BCN_1315
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BCN_1315
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(+)
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BCN_1397
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23
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(+)
SAM
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BCN_1398
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24
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(+)
SAM
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BCN_1412
BCN_1412
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(+)
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BCN_1460
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View Structure
26
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(+)
purine
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BCN_1550
BCN_1550
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View Structure
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(+)
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BCN_1565
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DOOR ID:
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BCN_1577
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(-)
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BCN_1741
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(+)
ydaO-yuaA
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BCN_1807
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31
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(-)
glycine
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BCN_2302
BCN_2302
Operon
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BCN_2302
View Structure
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(+)
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BCN_2521
BCN_2521
Operon
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BCN_2521
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(+)
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BCN_2906
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(-)
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(-)
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ydaO-yuaA
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BCN_3941
Operon
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BCN_3940
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BCN_3948
Operon
DOOR ID:
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BCN_3948
View Structure
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(+)
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BCN_4025
Operon
DOOR ID:
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View Structure
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(-)
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Operon
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BCN_4168
BCN_4168
Operon
DOOR ID:
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BCN_4169,
BCN_4168
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(-)
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(-)
SAM
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BCN_4882
BCN_4882
Operon
DOOR ID:
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BCN_4881,
BCN_4880,
BCN_4879
View Structure
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(+)
fluoride
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View Structure
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(-)
SAM
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DOOR ID:
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View Structure
Genome:
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Firmicutes
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