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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
95916-96018
(+)
purine
96084-97446 (+)
ERH_0078
Xanthine/uracil/vitamin C permease
ERH_0078
Single gene
DOOR ID:
3170210
ERH_0078
View Structure
2
325501-325622
(+)
TPP
325690-325987 (+)
ERH_0293
ERH_0293
Single gene
DOOR ID:
3170280
ERH_0293
View Structure
3
393698-393787
(+)
THF
393826-394333 (+)
ERH_0360
Putative membrane protein
ERH_0360
Operon
DOOR ID:
870502
ERH_0360,
ERH_0361
(fhs)
,
ERH_0362,
ERH_0363
View Structure
4
502591-502723
(+)
glmS
502748-504560 (+)
glmS
Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]
ERH_0460
Single gene
DOOR ID:
3170328
ERH_0460
(glmS)
View Structure
5
795411-795503
(+)
glycine
795511-797059 (+)
citF
Citrate lyase alpha chain (Citrase alpha chain) (Citrate (pro-3S)-lyase alpha chain) (Citrate CoA-transferase subunit)
ERH_0753
Operon
DOOR ID:
870577
ERH_0751
(citD)
,
ERH_0752
(citE)
,
ERH_0753
(citF)
,
ERH_0754,
ERH_0755
(oadA)
,
ERH_0756
(oadG)
,
ERH_0757,
ERH_0758
(oadB)
View Structure
6
935411-935508
(-)
purine
934525-935359 (-)
ERH_0879
Putative spermidine/putrescine ABC transporter; permease protein
ERH_0879
Operon
DOOR ID:
870602
ERH_0875
(ade)
,
ERH_0876,
ERH_0877,
ERH_0878,
ERH_0879
View Structure
7
935532-935634
(-)
purine
934525-935359 (-)
ERH_0879
Putative spermidine/putrescine ABC transporter; permease protein
ERH_0879
Operon
DOOR ID:
870602
ERH_0875
(ade)
,
ERH_0876,
ERH_0877,
ERH_0878,
ERH_0879
View Structure
8
950425-950591
(+)
lysine
950652-952266 (+)
ERH_0895
Amino acid ABC transporter; amino acid-binding and permease protein
ERH_0895
Operon
DOOR ID:
870605
ERH_0895,
ERH_0896
View Structure
9
1017485-1017600
(-)
FMN
1016911-1017439 (-)
ERH_0955
Riboflavin transporter
ERH_0955
Operon
DOOR ID:
870613
ERH_0951
(gpsA)
,
ERH_0952
(engA)
,
ERH_0953
(cmk)
,
ERH_0954,
ERH_0955
View Structure
10
1395228-1395329
(-)
purine
1393770-1395147 (-)
ERH_1333
Xanthine/uracil/vitamin C permease
ERH_1333
Operon
DOOR ID:
870682
ERH_1332
(xpt)
,
ERH_1333
View Structure
Genome:
Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa
(
NC_015601.1
);
Phylum:
Firmicutes
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Fujisawa ";i:3;s:10:"Firmicutes";i:4;s:4:"1239";i:5;s:13:"795411-795503";i:6;s:1:"+";i:7;s:7:"glycine";i:8;s:0:"";i:9;s:13:"795511-797059";i:10;s:1:"+";i:11;s:4:"citF";i:12;s:119:"Citrate lyase alpha chain (Citrase alpha chain) (Citrate (pro-3S)-lyase alpha chain) (Citrate CoA-transferase subunit)";i:13;s:8:"ERH_0753";i:14;s:6:"Operon";i:15;s:6:"870577";i:16;s:107:"ERH_0751(citD);ERH_0752(citE);ERH_0753(citF);ERH_0754;ERH_0755(oadA);ERH_0756(oadG);ERH_0757;ERH_0758(oadB)";i:17;s:41:"acetyl-CoA metabolic process [GO:0006084]";i:18;s:15:"View Structure ";}i:6;a:19:{i:0;i:6;i:1;s:11:"NC_015601.1";i:2;s:43:"Erysipelothrix rhusiopathiae str. 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