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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
303885-303973
(+)
TPP
304046-304769 (+)
HIBPF03030
HIBPF03030
Operon
DOOR ID:
791048
HIBPF03030,
HIBPF03040,
HIBPF03050,
HIBPF03060
View Structure
2
508381-508524
(+)
MOCO
509659-510100 (+)
HIBPF05680
HIBPF05680
Operon
DOOR ID:
791085
HIBPF05670,
HIBPF05680,
HIBPF05690,
HIBPF05700
View Structure
3
927070-927246
(-)
lysine
925491-927012 (-)
HIBPF09900
HIBPF09900
Single gene
DOOR ID:
3026065
HIBPF09900
View Structure
4
1021079-1021123
(+)
PreQ1
1021124-1021808 (+)
HIBPF10750
HIBPF10750
Operon
DOOR ID:
791183
HIBPF10750,
HIBPF10760,
HIBPF10770
View Structure
5
1185012-1185099
(-)
TPP
1183960-1184959 (-)
tbpA
HIBPF12390
Operon
DOOR ID:
791211
HIBPF12370,
HIBPF12380,
HIBPF12390
(tbpA)
View Structure
6
1352551-1352661
(+)
glycine
1352772-1354143 (+)
HIBPF14290
HIBPF14290
Single gene
DOOR ID:
3026190
HIBPF14290
View Structure
7
1449378-1449555
(-)
FMN
1448641-1449289 (-)
HIBPF15470
HIBPF15470
Operon
DOOR ID:
791266
HIBPF15461
(lpsA)
,
HIBPF15470
View Structure
8
1838269-1838357
(-)
TPP
1837347-1838139 (-)
HIBPF19200
HIBPF19200
Operon
DOOR ID:
791339
HIBPF19161,
HIBPF19180,
HIBPF19190,
HIBPF19200
View Structure
Genome:
Haemophilus influenzae F3031
(
NC_014920.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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