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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
525417-525506
(-)
TPP
524634-525357 (-)
Riean_0488
Riean_0488
Operon
DOOR ID:
1314037
Riean_0485,
Riean_0486,
Riean_0487,
Riean_0488
View Structure
2
1685065-1685155
(-)
TPP
1682877-1684995 (-)
Riean_1542
Riean_1542
Single gene
DOOR ID:
2995843
Riean_1542
View Structure
3
1737033-1737138
(-)
SAM
1736033-1736972 (-)
Riean_1578
Riean_1578
Operon
DOOR ID:
1314284
Riean_1576,
Riean_1577,
Riean_1578
View Structure
4
1965083-1965185
(+)
SAM
1965252-1966266 (+)
Riean_1780
Riean_1780
Operon
DOOR ID:
1314333
Riean_1780,
Riean_1781,
Riean_1782
View Structure
5
2078252-2078442
(+)
cobalamin
2080311-2081358 (+)
Riean_1900
Riean_1900
Operon
DOOR ID:
1314362
Riean_1899,
Riean_1900
View Structure
Genome:
Riemerella anatipestifer DSM 15868
(
NC_014738.1
);
Phylum:
Bacteroidetes/Chlorobi group
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