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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
196425-196551
(+)
THF
196592-197171 (+)
folT
LEGAS_0206
Single gene
DOOR ID:
2899811
LEGAS_0206
(folT)
View Structure
2
231126-231293
(+)
lysine
231370-232483 (+)
alr1
LEGAS_0236
Operon
DOOR ID:
726295
LEGAS_0236
(alr1)
,
LEGAS_0237
(asd)
,
LEGAS_0238
View Structure
3
345255-345422
(+)
lysine
345504-346944 (+)
LEGAS_0338
LEGAS_0338
Single gene
DOOR ID:
2899859
LEGAS_0338
View Structure
4
458175-458219
(+)
PreQ1
458238-459234 (+)
LEGAS_0456
LEGAS_0456
Operon
DOOR ID:
726348
LEGAS_0456,
LEGAS_0457
View Structure
5
471614-471703
(-)
TPP
470881-471463 (-)
LEGAS_0468
LEGAS_0468
Operon
DOOR ID:
726350
LEGAS_0465
(tenA)
,
LEGAS_0466,
LEGAS_0467,
LEGAS_0468
View Structure
6
492290-492392
(+)
SAM
492487-493645 (+)
metK
LEGAS_0489
Operon
DOOR ID:
726356
LEGAS_0489
(metK)
,
LEGAS_0490
View Structure
7
759773-759945
(+)
lysine
760074-761370 (+)
lysA
LEGAS_0742
Operon
DOOR ID:
726411
LEGAS_0742
(lysA)
,
LEGAS_0743
(dapD)
,
LEGAS_0744,
LEGAS_0745
(dapA)
,
LEGAS_0746
(dapB)
View Structure
8
1040273-1040320
(-)
PreQ1
1039702-1040266 (-)
queT
LEGAS_1020
Operon
DOOR ID:
726479
LEGAS_1019,
LEGAS_1020
(queT)
View Structure
9
1149779-1149914
(-)
FMN
1149123-1149711 (-)
ribU
LEGAS_1127
Single gene
DOOR ID:
2900082
LEGAS_1127
(ribU)
View Structure
10
1162875-1162972
(-)
TPP
1162086-1162728 (-)
LEGAS_1141
LEGAS_1141
Single gene
DOOR ID:
2900087
LEGAS_1141
View Structure
11
1163049-1163139
(-)
TPP
1162086-1162728 (-)
LEGAS_1141
LEGAS_1141
Single gene
DOOR ID:
2900087
LEGAS_1141
View Structure
12
1262507-1262603
(-)
purine
1261099-1262272 (-)
guaB1
LEGAS_1221
Operon
DOOR ID:
726525
LEGAS_1220
(guaB2)
,
LEGAS_1221
(guaB1)
View Structure
13
1592541-1592629
(-)
TPP
1591643-1592420 (-)
thiM
LEGAS_1548
Operon
DOOR ID:
726600
LEGAS_1546
(thiE)
,
LEGAS_1547
(thiD1)
,
LEGAS_1548
(thiM)
View Structure
Genome:
Leuconostoc gasicomitatum LMG 18811
(
NC_014319.1
);
Phylum:
Firmicutes
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