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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
275009-275190
(-)
ykoK
273938-274952 (-)
Kvar_0245
Kvar_0245
Single gene
DOOR ID:
2777911
Kvar_0245
View Structure
2
671578-671729
(+)
FMN
671834-672488 (+)
Kvar_0642
Kvar_0642
Single gene
DOOR ID:
2778039
Kvar_0642
View Structure
3
911406-911584
(+)
cobalamin
911676-913053 (+)
Kvar_0870
Kvar_0870
Operon
DOOR ID:
662434
Kvar_0870,
Kvar_0871,
Kvar_0872,
Kvar_0873,
Kvar_0874,
Kvar_0875,
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Kvar_0878,
Kvar_0879,
Kvar_0880,
Kvar_0881,
Kvar_0882,
Kvar_0883,
Kvar_0884,
Kvar_0885,
Kvar_0886,
Kvar_0887,
Kvar_0888
View Structure
4
1618486-1618583
(+)
TPP
1618617-1619391 (+)
Kvar_1516
Kvar_1516
Operon
DOOR ID:
662565
Kvar_1516,
Kvar_1517
View Structure
5
1960105-1960207
(-)
yybP-ykoY
1959420-1959987 (-)
Kvar_1845
Kvar_1845
Single gene
DOOR ID:
2778483
Kvar_1845
View Structure
6
2591718-2591797
(+)
ZMP-ZTP
2591814-2592447 (+)
Kvar_2483
Kvar_2483
Single gene
DOOR ID:
2778761
Kvar_2483
View Structure
7
2614475-2614576
(-)
TPP
2613710-2614406 (-)
Kvar_2503
Kvar_2503
Operon
DOOR ID:
662735
Kvar_2500,
Kvar_2501,
Kvar_2502,
Kvar_2503
View Structure
8
2677861-2677959
(+)
ykkC-yxkD
2678015-2679074 (+)
Kvar_2566
Kvar_2566
Operon
DOOR ID:
662745
Kvar_2566,
Kvar_2567,
Kvar_2568,
Kvar_2569,
Kvar_2570,
Kvar_2571,
Kvar_2572,
Kvar_2573
View Structure
9
2682166-2682213
(+)
mini-ykkC
2682232-2685838 (+)
Kvar_2572
Kvar_2572
Operon
DOOR ID:
662745
Kvar_2566,
Kvar_2567,
Kvar_2568,
Kvar_2569,
Kvar_2570,
Kvar_2571,
Kvar_2572,
Kvar_2573
View Structure
10
3571159-3571213
(+)
fluoride
3571757-3576206 (-)
Kvar_3425
Kvar_3425
Operon
DOOR ID:
662888
Kvar_3425,
Kvar_3426,
Kvar_3427,
Kvar_3428
View Structure
11
3741710-3741848
(-)
MOCO
3740196-3740709 (-)
Kvar_3570
Kvar_3570
Operon
DOOR ID:
662918
Kvar_3566,
Kvar_3567,
Kvar_3568,
Kvar_3569,
Kvar_3570,
Kvar_3571
View Structure
12
4562380-4562509
(+)
TPP
4562542-4563526 (+)
Kvar_4316
Kvar_4316
Operon
DOOR ID:
663074
Kvar_4316,
Kvar_4317,
Kvar_4318
View Structure
13
4888354-4888469
(-)
Mg sensor
4885546-4888255 (-)
Kvar_4601
Kvar_4601
Single gene
DOOR ID:
2779610
Kvar_4601
View Structure
14
4995792-4995836
(-)
mini-ykkC
4995460-4995778 (-)
Kvar_4703
Kvar_4703
Single gene
DOOR ID:
2779653
Kvar_4703
View Structure
15
5138375-5138610
(+)
lysine
5138789-5140139 (+)
Kvar_4832
Kvar_4832
Single gene
DOOR ID:
2779714
Kvar_4832
View Structure
16
5181004-5181128
(+)
TPP
5181214-5183110 (+)
Kvar_4866
Kvar_4866
Operon
DOOR ID:
663189
Kvar_4866,
Kvar_4867,
Kvar_4868,
Kvar_4869,
Kvar_4870,
Kvar_4871
View Structure
17
5309001-5309188
(-)
cobalamin
5307097-5308936 (-)
Kvar_4966
Kvar_4966
Operon
DOOR ID:
663210
Kvar_4965,
Kvar_4966
View Structure
Genome:
Klebsiella variicola At-22
(
NC_013850.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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