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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
334124-334266
(+)
ydaO-yuaA
334269-335223 (+)
Tcur_0305
Tcur_0305
Single gene
DOOR ID:
2727335
Tcur_0305
View Structure
2
376536-376721
(-)
cobalamin
375086-376400 (-)
Tcur_0344
Periplasmic binding protein
Tcur_0344
Operon
DOOR ID:
635881
Tcur_0342,
Tcur_0343,
Tcur_0344
View Structure
3
890419-890560
(+)
SAM
890575-891817 (+)
Tcur_0801
Threonine synthase
Tcur_0801
Operon
DOOR ID:
635972
Tcur_0801,
Tcur_0802
View Structure
4
1470813-1470937
(+)
cobalamin
1470997-1474792 (+)
Tcur_1291
Cobaltochelatase; CobN subunit
Tcur_1291
Single gene
DOOR ID:
2727787
Tcur_1291
View Structure
5
1489390-1489471
(+)
cobalamin
1489585-1491559 (+)
Tcur_1309
Cobaltochelatase subunit
Tcur_1309
Operon
DOOR ID:
636071
Tcur_1309,
Tcur_1310,
Tcur_1311,
Tcur_1312
View Structure
6
1558156-1558277
(+)
ydaO-yuaA
1558280-1559330 (+)
Tcur_1369
Tcur_1369
Single gene
DOOR ID:
2727821
Tcur_1369
View Structure
7
2826704-2826799
(-)
glycine
2823646-2826490 (-)
Tcur_2429
Glycine dehydrogenase (decarboxylating) (Glycine cleavage system P-protein) (Glycine decarboxylase) (Glycine dehydrogenase (aminomethyl-transferring))
Tcur_2429
Single gene
DOOR ID:
2728286
Tcur_2429
View Structure
8
2839494-2839605
(+)
TPP
2841502-2842552 (-)
Tcur_2441
Peptidase alpha-lytic pro domain protein
Tcur_2441
Single gene
DOOR ID:
2728296
Tcur_2441
View Structure
9
3481548-3481678
(-)
FMN
3480683-3481292 (-)
Tcur_2996
Riboflavin synthase; alpha subunit
Tcur_2996
Single gene
DOOR ID:
2728519
Tcur_2996
View Structure
10
3518505-3518618
(+)
TPP
3519754-3519955 (+)
Tcur_3034
Thiamine biosynthesis protein ThiS
Tcur_3034
Operon
DOOR ID:
636401
Tcur_3033,
Tcur_3034,
Tcur_3035
View Structure
11
3559840-3560016
(+)
ydaO-yuaA
3560147-3560252 (+)
Tcur_3071
Tcur_3071
Single gene
DOOR ID:
2728548
Tcur_3071
View Structure
12
3560385-3560534
(+)
ydaO-yuaA
3560538-3561315 (+)
Tcur_3072
CHAP domain containing protein
Tcur_3072
Single gene
DOOR ID:
2728549
Tcur_3072
View Structure
13
4395167-4395263
(+)
glycine
4395425-4396535 (+)
Tcur_3845
Aminomethyltransferase (0) (Glycine cleavage system T protein)
Tcur_3845
Operon
DOOR ID:
636562
Tcur_3845,
Tcur_3846,
Tcur_3847
View Structure
14
4395268-4395356
(+)
glycine
4395425-4396535 (+)
Tcur_3845
Aminomethyltransferase (0) (Glycine cleavage system T protein)
Tcur_3845
Operon
DOOR ID:
636562
Tcur_3845,
Tcur_3846,
Tcur_3847
View Structure
15
5079159-5079383
(+)
ydaO-yuaA
5079390-5080413 (+)
Tcur_4480
NLP/P60 protein
Tcur_4480
Single gene
DOOR ID:
2729137
Tcur_4480
View Structure
16
5345295-5345537
(+)
cobalamin
5345570-5346248 (+)
Tcur_4719
Cobalt transport protein CbiM (Energy-coupling factor transporter probable substrate-capture protein CbiM) (ECF transporter S component CbiM)
Tcur_4719
Operon
DOOR ID:
636737
Tcur_4719,
Tcur_4720,
Tcur_4721,
Tcur_4722
View Structure
Genome:
Thermomonospora curvata DSM 43183
(
NC_013510.1
);
Phylum:
Actinobacteria
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