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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
117139-117326
(+)
cobalamin
117390-119229 (+)
btuB
KP1_0121
Operon
DOOR ID:
564933
KP1_0121
(btuB)
,
KP1_0122
View Structure
2
245458-245582
(-)
TPP
243476-245372 (-)
thiC
KP1_0234
Operon
DOOR ID:
564953
KP1_0229
(thiH)
,
KP1_0230
(thiG)
,
KP1_0231
(thiS)
,
KP1_0232
(thiF)
,
KP1_0233
(thiE)
,
KP1_0234
(thiC)
View Structure
3
280836-281071
(-)
lysine
279306-280656 (-)
lysC
KP1_0263
Single gene
DOOR ID:
2582794
KP1_0263
(lysC)
View Structure
4
423578-423622
(+)
mini-ykkC
423635-423953 (+)
sugE
KP1_0420
Single gene
DOOR ID:
2582861
KP1_0420
(sugE)
View Structure
5
525031-525147
(+)
Mg sensor
525245-527954 (+)
mgtA
KP1_0533
Single gene
DOOR ID:
2582908
KP1_0533
(mgtA)
View Structure
6
864449-864578
(-)
TPP
863431-864415 (-)
tbpA
KP1_0880
Operon
DOOR ID:
565071
KP1_0878
(thiQ)
,
KP1_0879
(thiP)
,
KP1_0880
(tbpA)
View Structure
7
1704985-1705123
(+)
MOCO
1706123-1706636 (+)
moaB
KP1_1765
Operon
DOOR ID:
565243
KP1_1764
(moaA)
,
KP1_1765
(moaB)
,
KP1_1766
(moaC)
,
KP1_1767
(moaD)
,
KP1_1768
(moaE)
,
KP1_1769
(ybhL)
View Structure
8
2715152-2715253
(+)
TPP
2715321-2716017 (+)
KP1_2847
KP1_2847
Operon
DOOR ID:
565425
KP1_2847,
KP1_2849,
KP1_2850,
KP1_2851
View Structure
9
3283414-3283516
(+)
yybP-ykoY
3283633-3284200 (+)
yebN
KP1_3462
Single gene
DOOR ID:
2583972
KP1_3462
(yebN)
View Structure
10
3595809-3595906
(-)
TPP
3595000-3595774 (-)
thiM
KP1_3769
Operon
DOOR ID:
565575
KP1_3768
(thiD)
,
KP1_3769
(thiM)
View Structure
11
4284894-4285072
(-)
cobalamin
4283424-4284879 (-)
KP1_4466
KP1_4466
Operon
DOOR ID:
565707
KP1_4446
(cobT)
,
KP1_4448
(cobU)
,
KP1_4449,
KP1_4450
(cbiO)
,
KP1_4451
(cbiQ)
,
KP1_4452,
KP1_4453,
KP1_4454,
KP1_4455,
KP1_4456,
KP1_4457,
KP1_4458,
KP1_4459,
KP1_4460,
KP1_4461,
KP1_4463
(cbiD)
,
KP1_4464
(cbiC)
,
KP1_4465
(cobD)
,
KP1_4466
View Structure
12
4528049-4528200
(-)
FMN
4527289-4527943 (-)
ribB
KP1_4736
Single gene
DOOR ID:
2584414
KP1_4736
(ribB)
View Structure
13
4926704-4926885
(+)
ykoK
4926942-4927956 (+)
mgtE
KP1_5196
Single gene
DOOR ID:
2584546
KP1_5196
(mgtE)
View Structure
Genome:
Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044
(
NC_012731.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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