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S.No.
Riboswitch Location and Strand
Riboswitch class
Downstream gene location and Strand
Downstream gene name/gene product description
Locus_tag of downstream gene
Single gene/within operon (According to DOOR database)
Operon details (List of genes within operon and their Locus_tag)
Predicted Structure
1
557909-558014
(+)
TPP
558160-560065 (+)
thiC
PFLU0492
Single gene
DOOR ID:
2568243
PFLU0492
(thiC)
View Structure
2
1019687-1019806
(-)
yybP-ykoY
1019012-1019597 (-)
PFLU0918
PFLU0918
Single gene
DOOR ID:
2568391
PFLU0918
View Structure
3
2047712-2047764
(-)
mini-ykkC
2047376-2047691 (-)
sugE
PFLU1875
Single gene
DOOR ID:
2568790
PFLU1875
(sugE)
View Structure
4
2081784-2081856
(-)
fluoride
2080356-2081703 (-)
PFLU1908
PFLU1908
Operon
DOOR ID:
557745
PFLU1907,
PFLU1908
View Structure
5
2943100-2943306
(-)
cobalamin
2942814-2943003 (-)
PFLU2668
PFLU2668
Operon
DOOR ID:
557876
PFLU2666,
PFLU2667,
PFLU2668
View Structure
6
2944182-2944381
(+)
cobalamin
2944473-2945535 (+)
PFLU2669
PFLU2669
Operon
DOOR ID:
557877
PFLU2669,
PFLU2670
(cobN)
View Structure
7
4663279-4663474
(+)
cobalamin
4663589-4664600 (+)
PFLU4219
PFLU4219
Operon
DOOR ID:
558158
PFLU4219,
PFLU4220,
PFLU4221
View Structure
8
4959120-4959373
(-)
cobalamin
4958430-4959042 (-)
PFLU4491
PFLU4491
Operon
DOOR ID:
558203
PFLU4486,
PFLU4487,
PFLU4488
(cobD)
,
PFLU4489,
PFLU4490,
PFLU4491
View Structure
9
5226269-5226438
(+)
FMN
5226534-5227044 (+)
PFLU4750
PFLU4750
Single gene
DOOR ID:
2569934
PFLU4750
View Structure
10
6270688-6270794
(+)
SAH
6270815-6272225 (+)
sahA
PFLU5720
Single gene
DOOR ID:
2570329
PFLU5720
(sahA)
View Structure
Genome:
Pseudomonas fluorescens SBW25
(
NC_012660.1
);
Phylum:
Gammaproteobacteria
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